Πρωτόκολλο για τον προσδιορισμό του μύκητα

page-template,page-template-full_width,page-template-full_width-php,page,page-id-1240,bridge-core-2.8.2,,qode-page-loading-effect-enabled,qode_grid_1200,side_menu_slide_with_content,width_470,qode-content-sidebar-responsive,qode-child-theme-ver-1.0.0,qode-theme-ver-26.6,qode-theme-bridge,qode_header_in_grid,wpb-js-composer js-comp-ver-6.6.0,vc_responsive

Πρωτόκολλο για τον προσδιορισμό του μύκητα

Για την εφαρμογή του συστήματος πρόβλεψης της ασθένειας, αλλά και κυρίως για την μετά την Πράξη αξιοποίηση των αποτελεσμάτων της έρευνας, απαιτείται μια αξιόπιστη, γρήγορη και οικονομική μέθοδος ανίχνευσης και εκτίμησης του πληθυσμού του παθογόνου στους φυτικούς ιστούς της ελιάς.

H διάγνωση του μύκητα Colletotrichum spp. γίνεται κυρίως με κλασικές μικροβιολογικές μεθόδους που αφορούν την απομόνωσή του από μολυσμένο φυτικό ιστό και την αναγνώρισή του με μικροσκοπική παρατήρηση της μορφολογίας του.

H μέθοδος που θα χρησιμοποιηθεί είναι η PCR πραγματικού χρόνου (Real Time PCR, RT-PCR) η οποία δίνει τη δυνατότητα υπολογισμού της ποσότητας του γενετικού υλικού και κατά συνέπεια του πληθυσμού του παθογόνου με πολύ μεγάλη ακρίβεια.

Η μεθοδολογία υλοποίησης περιλαμβάνει:

Δημιουργία εξειδικευμένων εκκινητών. Θα ακολουθήσει υποκλωνοποίηση σε πλασμίδιο κατάλληλου φορέα και υπολογισμός της συγκέντρωσης του γενετικού υλικού με φωτομετρική μέθοδο.

Προσδιορισμός του αριθμού των κυττάρων και του είδους του μύκητα στους φυτικούς ιστούς. Με την εφαρμογή της μεθόδου θα υπάρχει δυνατότητα ανίχνευσης των ενδημικών στελεχών του γλοιοσπορίου αλλά και να υπολογίζεται ο πληθυσμός του σε οποιοδήποτε δείγμα φυτικού ιστού.